请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版

分子模拟论坛 Molecular Simulation Forums

 找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
查看: 415|回复: 0

NAMD运行后出现提示盒子太小怎么办?各位大神请指教

[复制链接]

6

主题

6

帖子

20

积分

新手上路

Rank: 1

积分
20
发表于 2013-5-31 12:44:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
FATAL ERROR: Periodic cell has become too small for original patch grid!
Possible solutions are to restart from a recent checkpoint,
increase margin, or disable useFlexibleCell for liquid simulation.
我模拟的是短肽只有21个AA盒子边缘设置
# Periodic Boundary Conditions
cellBasisVector1  132.0  0. 0.0
cellBasisVector2 0.065.0 0.0
cellBasisVector3 0.0  0 70.0
cellOrigin    13.9539537430 7.1216459274-15.0715799332
依然出现如开头所标提示,求指教解决
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

Archiver|手机版|小黑屋|分子模拟论坛

GMT+8, 2020-7-4 17:21 , Processed in 0.064186 second(s), 26 queries .

Powered by Discuz! X3.4

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表