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关于charmm中的QM/MM计算

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发表于 2008-10-23 16:59:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
本人初学charmm,想做QM/MM计算,QM部份近来一般都用SCCDFTB方法做,请问下要如何安装SCCDFTB部份然后才能使用呢?听一老师说的一般的charmm中带的SCFDDTB都不能使用,是真的么?还有学院买了服务器,需怎样编译并行计算?非常感谢了。。
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发表于 2009-3-10 15:25:00 | 显示全部楼层
慢得让人受不了.
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新手上路

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发表于 2009-8-3 16:02:00 | 显示全部楼层
qm一般都用SCCDFTB?好象不是吧。也有用GAMES,GAMES-UK的
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发表于 2009-8-30 18:12:00 | 显示全部楼层
SCCDFTB是一种紧束缚TB方法,它需要一堆参数才能进行计算,可是charmm中没有带它的参数,所以一般是不能用的。需要给开发该算法的课题组写邮件来索要参数,当然也可以要源代码。在charmm的doc文件里面应该是给出了联系方式的。。。。。另外这个方法也有其局限性,从头算的QMMM的话,CHARMM可以和GAMESS,Q-CHEM连用,还有一些半经验方法,像AM1,CNDO等等,是CHARMM软件包的一部分,可以使用相关的关键字来直接调用。。。。
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发表于 2009-9-2 01:53:00 | 显示全部楼层
SCCDFTB code是威斯康星大学Cui Qiang教授写的,现在好像有带这部分code,但是如果你没有SCCDFTB那部分的QM参数文件,就算编译过了也是不能用的。
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发表于 2009-12-20 14:06:00 | 显示全部楼层
请问能不能给些QM/MM的具体例子
不胜感激
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发表于 2010-1-18 20:04:00 | 显示全部楼层
例子test下就有啊
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发表于 2011-4-23 21:29:00 | 显示全部楼层
我最近也急需要charmm做qmmm的计算 可是我是用gauss的 对charmm真的是一窍不通啊 谁能帮帮我啊
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发表于 2012-1-16 00:32:00 | 显示全部楼层
这个很麻烦的~~~而且很慢……
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