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[OpenBbael] Linux(64位)下OpenBabel 2.4.1、python2.7和Ipython实战

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发表于 2018-8-7 09:17:36 | 显示全部楼层 |阅读模式

基于OpenBabel2.4.1的Python绑定开发,我自己绑定的Python版本为Python2.7.

openbabel2.4手手册和pybel和openbabel库的使用。

下面是手册中的一个例子,练手!


import openbabel, pybel

mol = openbabel.OBMol()
a = mol.NewAtom()
a.SetAtomicNum(6)   # carbon atom
a.SetVector(0.0, 1.0, 2.0) # coordinates
b = mol.NewAtom()
mol.AddBond(1, 2, 1)   # atoms indexed from 1

pybelmol = pybel.Molecule(mol)
pybelmol.write("sdf", "outputfile.sdf")


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