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VMD如何保存pdb文件

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发表于 2012-10-12 11:15:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
我想把gro转成pdb文件。试过 pdb2gmx -f file.gro -o file.pdb, 但系统提示错误,说找不到离子,奇怪了,我的topol.top文件里明明有ions.itp 和 离子名称以及个数。如果用命令不好转的话,用VMD如何转?请说得详细一些,谢谢!
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发表于 2012-10-12 15:42:00 | 显示全部楼层
editconf -f *.gro -o *.pdb
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 楼主| 发表于 2012-10-13 10:40:00 | 显示全部楼层
非常感谢!另外,你的签名很个性~
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发表于 2013-5-13 21:32:00 | 显示全部楼层
2# 水木年华 你好,偶然间看到了你的帖子,我现在也在民航大学,最近刚接触用lammps做论文。你有时间的时候能否向你请教一下分子模拟的一些问题?
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发表于 2019-3-15 10:30:46 | 显示全部楼层
vmd打开之后点右击会弹出一个框,保存坐标命令为*.pdb就可以了
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