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VMD Density Profile Tool

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发表于 2012-1-5 09:15:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
VMD有一个第三方插件VMD Density Profile Tool,可以根据原子类型分析密度分布
哪位大神知道怎么安装啊?
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发表于 2012-1-5 11:07:00 | 显示全部楼层
我刚在windows下试了下。
1、首先找到vmd安装目录/plugins/noarch/tcl/ 目录下新建一个文件夹叫 init.d
2.将density_profile_vmd.tcl 拷进init.d文件夹中,启动vmd,在Analysis里就有个density profile tools
3、没了,就是上面两条,灰常简单
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 楼主| 发表于 2012-1-5 12:12:00 | 显示全部楼层
本帖最后由 476992939 于 2012-1-5 12:45 编辑
2# dndxwoaini
我之前就试过了,不行啊,不对,我下载的资源里没有density_profile_vmd.tcl 这个文件啊!
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 楼主| 发表于 2012-1-5 12:48:00 | 显示全部楼层
ok,解决了!
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 楼主| 发表于 2012-1-5 13:33:00 | 显示全部楼层
2# dndxwoaini
那这个图是怎么做出来的啊?我为什么会出现下面的错误呢?
expected integer but got ""
expected integer but got ""
  while executing
"incr f $fstep"
  (procedure "do_plot" line 23)
  invoked from within
"do_plot"
  (procedure "plot_command" line 2)
  invoked from within
"plot_command"
  (in namespace inscope "::density_profile" script line 1)
  invoked from within
"::namespace inscope ::density_profile plot_command"
  invoked from within
".density_profile.plot invoke"
  ("uplevel" body line 1)
  invoked from within
"uplevel #0 [list $w invoke]"
  (procedure "tk::ButtonUp" line 24)
  invoked from within
"tk::ButtonUp .density_profile.plot"
  (command bound to event)
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发表于 2012-2-2 16:44:00 | 显示全部楼层
你好请问一下density_profile_vmd.tcl 在哪里能下载呀 能给我传一个吗 谢谢 QQ854451168
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发表于 2012-2-16 00:06:00 | 显示全部楼层
你好请问一下density_profile_vmd.tcl 在哪里能下载呀 能给我传一个吗 谢谢 QQ854451168
li321 发表于 2012-2-2 16:44
解压后按照里边INSTALL文件里的介绍安装。
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发表于 2012-2-2 16:44:00 | 显示全部楼层
解压后按照里边INSTALL文件里的介绍安装。
hongye 发表于 2012-2-16 00:06
density_profile_vmd.tcl 文件,是不是就是里面的density_profile.tcl 文件呀?
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发表于 2012-2-16 11:26:00 | 显示全部楼层
学习一下
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发表于 2012-2-16 00:06:00 | 显示全部楼层
不懂问一下,这个plugin能不能分析一系列frames,还是只能分析一个frame?
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